古生物学

概览

古生物体学从骨骼,牙齿出土了基因组信息;沉积物被保存下来的组织及历史标本. 古代DNA被分解,化学改造并和环保分子及现代的多入相混合. 然而,真实的序列数据揭示出祖先、迁徙相通地貌学和病原体历史。 适应性化与内生过程超出了形态或当今基因组所能单独解决的范围取而代之的程度;

技术基础

死亡后,内生DNA会进行水解取出并被氧化和微生物入侵. 分子缩短,细胞氨酸去除离碎片末端产生特征明显的替代. 深花地骨和牙水泥可以保存出高自有分量,但保护差异很大. 单弦库方法能回收非常短的分子,而部分损坏修复则可以提高准确性并同时保留认证信号. 人类还另外含有现代的接取者DNA,而古代微生物群落使分类任务复杂化. 分子性,亲缘关系和异氧基苯二甲酸盐的分泌率可以在不同覆盖阈值下估算出.

如何运作

工程开始于物理隔离的清洁室,有被去污标本和取出空白. 图书馆捕捉出短分子并可能丰富线粒体DNA,所选的地基或整个基因组. 生物地道管图读取,模型特征终端损坏相接;估计污染并比较亚麻频率与古代和现代的参照板. 统计模型然后检验人口历史,同时说明覆盖率低和不确定性。

衡量和研究方法

分析管线修剪适配器,将重叠读取和映射与适合被短损碎片的参数相合并. 空控显示实验室污染物。 男性的氧化物污染、X-铬化估计和与工作人员或参考板等同起来,提供了补充检查。 基因类型的可能性比低深度强迫Diploid呼叫更好地保存不确定性。 人口分析采用主要成分投影、f-统计学,相混合图和合力模型等方法进行模拟以测试可识别性。 放射性碳酸枣和考古学背景被明确纳入其中,而不是从基因组分类中推断出来。

二. 主要想法

• 古老的样品是有限的文化和生物资源,因此破坏性取样必须合理和最小。
• DNA损伤模式有助于鉴定分子,但不会去除所有污染或偏差的来源.
• 遗传相关,考古文化和个人身份是不同的概念而不得混同.

目前的研究领域

沉积物DNA和古蛋白质组学在缺乏可识别骨骼材料的情况下,可以推论。 目标明确的捕获能够进行人口规模的取样,而长读和外生重建仍受分子保存的限制。 研究越来越多地与宿主基因组一起对病原体进化和生态系统更替进行研究. 技术进步不能取代道德伙伴关系:抽样计划应当有保管人和后裔社区参与,记录破坏性数量并具体说明返回或再葬情况。 公开的问题涉及有偏见的咨商小组、社区和个人隐私以及交流概率祖先,而不将生物种族重新确定或直接把遗传学绘制到语言和文化上。

为什么它很重要

古生物体学改变了对人类史前,作物和动物驯化以及传染病演变的理解. 时间标注的基因组可以直接观察人口变化,而不只是活生取出后裔推论.

限制和未决问题

保护在气候和土壤中并不均衡,造成了强烈的地理和社会抽样偏差。 参考数据库仍然不完整,人口模型无法识别。 结果对后裔社区来说在同意、管理以及解释和数据获取方面负有道德义务取义于人性化的特征(例如: