色素结构

概览

克罗马汀架构描述了DNA分子从核糖体折叠成环,域相接地段和染色體領土的时间. 这个组织是动态的,而不是固定脚手架. 它影响到哪些增强者与促进者的接触,复制如何进行、DNA损伤在何处修复以及哪个基因组区在特定细胞状态下仍然活跃或被抑制。

技术基础

克罗马汀是一种聚合物,其单体为核糖素;但其折叠受序列特异性蛋白质所制约并受到抄录活性和核能环境等. 环外线模型将克西辛作为运动相类复合物,会扩大一个铬回路直到释放或聚合的CTF边界. 在更大的范围内,活跃或不活动区域之间的优惠互动产生A和B区间。 聚变群调和了频繁的局部接触与细胞间的实质性可变性. 地表应力,凝固和与拉米纳或核糖体的系接会形成额外的组织层.

如何运作

科黑辛复合体可以挤出环,直到它们遇到CTF等面向边界的蛋白质后再进行分解相接活化处理来帮助形成接触域. 活性与不活跃的克氏血红素通过聚合物相互作用和相伴蛋白将分泌为宽隔膜. 转录,超接合相位取核拉米纳附件和分期收缩能进一步塑造出本地的接触. 在相模分化期间,间接组织被紧凑染色体所取代后再进行分裂重建.

衡量和研究方法

相接的DNA分解法,在顺序和偏差修正后产生接触基质。 成像方法如多相荧光在位混合后直接被单细胞所分泌出痕量活体标记来移动. 蛋白质中心测定出地平线图 CTCF,直肠分纹和抄录因子. 扰动使用去克龙,删除边界或定向招募等方法来进行抄录和联系测量. 必须报告分辨率、细胞数和基因组距离以及分批效应,因为它们强烈地影响明显的域与环.

二. 主要想法

• 接触频率图报告人口概率,而不是每个细胞共用的一字形结构.
• 增强相近性可以支持调控,而无需证明被检测到的接触是因果.
• 基因组序列,上位态相接性能活化分解法(英语:Ceptional state)和核力学共同决定折叠.

目前的研究领域

目前的研究将单细胞的相容,成像性能取用能力入手化了起来;并结合出可读性的转录和分系数据来与被接合到"活体命运(英语:Cell Etterality) "连接. 机械学研究询问接触何时驱动基因调控,以及两者是什么时候从第三个过程产生的. 疾病工作审查加强劫持、重复扩张和改变分化。 合成回路系统可能测试因果规则或控制治疗基因. 其余的问题包括从稀有的快照中重建动态四维轨迹,并解释局部分子事件如何在不假定一个共识结构的情况下将可再生染色体地域规模化.

为什么它很重要

三维基因组分析解释了遥远的调控变体如何会影响取出遗传,以及为什么结构再排列有时也会激活肿瘤. 它为发育生物学,罕见病诊断学以及癌症研究和工程基因调控策略提供参考而无需改变蛋白质编码序列.

限制和未决问题

色素结构因细胞和时间而异,大多数的测定结果平均为百万分之一单胞溶解或交易覆盖. 交叉联系和重建可带来偏见。 扰动建筑蛋白经常会同时改变抄录和细胞生理学,使得直接折叠机制与副作用难以分离.